Оцінювання результатів навчальних досягнень здобувачів освіти Харківського ліцею № 39 здійснюється відповідно до Закону України "Про повну загальну середню освіту" (р.ІІІ ст.17.п.4) за системою оцінювання, визначеною законодавством:
та інших орієнтовних вимог оцінювання навчальних досягнень учнів із базових дисциплін у системі загальної середньої освіти
Оцінювання відповідності результатів навчання учнів, які завершили здобуття початкової, базової середньої чи профільної середньої освіти, вимогам державних стандартів здійснюється шляхом державної підсумкової атестації (відповідно до Закону України "Про повну загальну середню освіту р.ІІІ, ст.17.п.5)